医学院前身是1958年创办的舟山卫生学校。2000年舟山卫生学校整体并入浙江海洋学院，成立医学院，先后开设护理、医学检验和药学等专业。2006年随着食品系的并入，成立食品与药学学院、医学院。2013年医学院以护理学专业为主体，转入东海科学技术学院，成立东海科学技术学院医学院，开设护理学和食品卫生与营养两个本科专业。

悠悠60余载，砥砺前行，医学院经历了大半个世纪艰难曲折的办学历程，在海岛医药卫生等领域和行业取得了辉煌的成就，先后为舟山乃至全国培养了大量的医药专业人才，毕业生遍布全省各地，也涌现出一大批坚守海岛的优秀医学人才，为改变海岛群众看病就医难的状况，也为国家和地方医药卫生建设做出了应有的贡献。

为响应浙江省共同富裕示范区的卫生健康领域高质量发展要求，加快推动优质医疗卫生资源在海岛地区的有序扩容和均衡布局，构建优质高效的整合型医疗卫生服务体系。在舟山市政府和社会各界的关心和支持下，浙江海洋大学重启医学院建设，目前已开设护理本科专业，2023年开始招生。

学院现有教职工16人及外聘兼职教授2人，其中博士3名，高级职称7名。学院拥有基础医学、护理学2个教研室，建有基础医学和护理学2个实验教学中心，总面积4000余平方米，仪器设备总价值800余万元。基础医学实验教学中心涵盖人体解剖学、微观形态学、机能学、生物化学与分子生物学共4个实验室；护理学实验教学中心下设内科护理实训室、外科护理实训室、ICU实训室、临床技能训练室、母婴护理室、手术室等共21个实验室，并建有省级技术研发推广平台“护理学数字化仿真实验教学平台”及美国研发的临床思维训练及评测系统（DxR Clinician/DxR Nursing SELECT）。现有基础医学和护理学2个实验教学中心建有省级技术研发推广平台“护理学数字化仿真实验教学平台”。投入资金300万元，引入美国研发的临床思维训练及评测系统(DxR clinician/DxR nursing SELECT)，构建护理学“数字化仿真模拟教学平台”。今后将逐步开设公共卫生、康复医学等专业，探索海洋医学学科建设，组建海洋医学科创中心，建成以临床医疗、预防保健和康养为一体的具有海岛特色的医学院，以适应国家对医学专业人才多层次的需求。